3. Ergenekon iddianamesinin 1 numaralı sanığı Prof. Dr. Yalçın Küçük'ün Cumhuriyet'in bombalanması için “iyi oldu” şeklinde not düştüğü ortaya çıktı. Notlarında yakın dostu gazeteci Uğur Mumcu'yu devletin öldürdüğünü yazan Küçük'ün “Darbe oluşuyor. Otuz bin özel tim. Kürtlerden oluşacak. İyi yerdeyiz” notu da dikkat çekti.
Ergenekon soruşturmasının 3. iddianamesinde 1 numaralı sanık olarak yeralan Prof. Dr. Yalçın Küçük'ün evinde ele geçirilen ajandasına yazdığı notlar dikkat çekti. Cumhuriyet Gazetesi'ne saldırılarla ilgili “İçim rahatladı. Bu yobazları yeneriz” diyor. Küçük, darbe çalışmalarıyla ilgili de "Darbe oluşuyor. Yepyeni bir Türkiye. Otuz bin özel tim. Kürtlerden oluşacak. Çok iyi bir yerdeyiz" ifadesini kullanıyor.
Küçük'ün İstanbul Şişli'deki Cumhuriyet Gazetesi'ne 5 Mayıs 2006'da el bombası atılması konusunda “İçim rahatladı', “Bu yobazları yeneriz', “Yüksek Yargı bayrağı yüksek tutuyor' şeklinde ajandasına notlar aldığı görüldü. Bu notların alındığı tarihten birkaç gün sonra aynı gazeteye 10 ve 11 Mayıs 2009'da yine el bombalı iki saldırı eylemi yapılması, iddianamede “Şüphelinin bu eylemlerin yapılacağını bildiği ve kendilerine güven duyduğunu belirttiği' şeklinde yer aldı.
Küçük'ün 17 Mayıs 2006'da gerçekleşen Danıştay saldırısından bir gün önce aldığı notlar da iddianamede yer aldı. Ajandasına “İçimde ışıklar var' şeklinde notlar alan Küçük'ün, saldırı sonrası cenaze töreninde yaşanan kargaşa hakkında da “İç savaş yeniden başladı. Üye Yücel Özbilgin ölümü ile iç savaş da bayrak oldu. Artık yeni bir dönem başlıyor' cümleleri dikkat çekti. İddianamede “Alınan notların bu eylemlerin Ergenekon terör örgütünün eylemleri olduğunu ve şüpheli Küçük'ün de eylemler hakkında bilgi sahibi olduğunu göstermektedir' değerlendirilmesine yer verildi.
Küçük yakın dostu Gazeteci Uğur Mumcu'nun öldürülmesiyle ilgili de ajandasına olaydan 4 gün sonra düştüğü notta "Uğur'u devlet öldürdü" diyor. Küçük'ün Bir sonraki notta yazdığı "Bir suikast bekliyordum. Milletvekili arkadaşımız Mehmet Sincar katledildi. Batman'da devlet öldürdü. Altında kalacaklar" notu da dikkat çekti.
Hakim ve Savcılar Yüksek Kurulu'nda Ergenekon savcılarını görevden almak isteyen üye Ali Suat Ertosun'un 'tarımı konuştuk' dediği Kent Otel'deki toplantılara 3. iddianamede geniş yer verildi. İddianamede Ertosun'un 'vefa gereği görüştüm' dediği Ergenekon sanığı Engin Aydın'ın Kent Otel'deki darbe toplantılarını organize ettiği belirtildi.
Ergenekon savcıları, Sanık Engin Aydın'ın, Kent Otel toplantılarını Cumhuriyet Gazetesi İmtiyaz Sahibi İlhan Selçuk'un talimatı doğrultusunda organize ettiğini belirledi. Selçuk'un bu toplantıları organize ettiği ancak Ergenekon soruşturmasından dolayı bu toplantılara katılmaktan vazgeçtiği tespit edildi. İddianamede Aydın'ın Kent Otel toplantılarına katılan kişiler arasından tespit ettiği bazı şahıslarla örgütün amaç ve stratejilerini anlatmak ve örgütün propagandasını yapmak amacıyla küçük gruplar halinde 'Ehli Dil' ve 'Perşembe Toplantıları' adı altında gizli toplantılar yaptığına yer verildi.
Ertosun, katıldığını söylediği Kent Otel toplantılarında ağırlıklı olarak AK Parti hükümetine karşı 'darbe'nin konuşulduğu da iddianameye girdi. İddianamede Ergenekon sanığı emekli Orgeneral Hurşit Tolon'un, emekli Tümgeneral Erdal Şenel'den Kent Otel toplantılarına katılanların isim listesini istediği ancak Şenel'in buna tepki gösterdiği belirtildi.
Başbakan Erdoğan'a yönelik suikast planı yapan Ergenekon sanığı Yarbay Mustafa Dönmez'in, 1. davanın sanığı Emin Gürses'le dinlemeye takılan telefon görüşmesinde “Başbakan'ın ipi çekildi” dediği tespit edildi. 3. Ergenekon iddianamesine konan görüşme şöyle:
Gürses: Ama kimse birşey demedi. Onlara demeyince bak yine operasyon geliyor. Profesörlere yapacaklarmış, bazı akademisyenlere operasyon. Dün Tayyip Erdoğan kendi ağzından kaçırdı, 'devamı gelecek operasyonların' diyor. Dönmez: Ama, ama bak onun ipi çekildi. Bu lafımı unutma
Gürses: ....kendi kendine...
Dönmez: O'nun ipi bu vuruşarak çekiliyor.....
Dönmez'in ajandasında bulunan ve 3. iddianameye konan konan Başbakan Erdoğan'a yönelik suikast planının uzaydan çekilmiş görüntülerle hazırlandığı belirlendi. Eylemin, Erdoğan'ın evine “200 metre mesafe”den gerçekleştirileceği tespit edildi.
