Donanma'da ele geçirilen belgelere göre, Balyozcular Ege'de ateş açma yetkisini dönemin Genelkurmay Başkanı Özkök'ten alarak Deniz Kuvvetleri Komutanı Özden Örnek'e devretmeye çalıştı.
Balyoz'u hazırlayan cuntanın, Yunanistan'la Ege'de gerginlik çıkararak darbeye zemin hazırlamayı öngören 'Suga' eylem planına hukuki zemin oluşturmak için de çalışma yaptığı ortaya çıktı. Ege'de Yunanistan'la meydana gelen gerginliklerde, Türk Deniz Kuvvetleri'nin vereceği tepkiyi düzenleyen kuralların iptal yetkisini Genelkurmay Başkanlığı'ndan alarak Deniz Kuvvetleri'ne devredilmesi için yapılan çalışmalar, Gölcük Donanma Komutanlığı'nda ele geçirilen belgeler arasında yeraldı.
Dönemin Genelkurmay Başkanı Orgeneral Özkök'ün yetkisinde olan angajman kurallarının değiştirilmesine yönelik Kasım 2002 tarihli, Dz. Kur. Yb Z. Erdim İnal'ın hazırladığı bilgi notunda “SUGA Harekat Planı icrasında, ihtiyaç duyulması halinde TSK Milli Angajman Kuralları Yönergesinin güncelleştirilmesinin uygun olduğu değerlendirilmektedir” denildi. Dz. Kur. Kd. Albay Mustafa Karasabun ise 3 Ocak 2003 tarihli bilgi notunda konuyla ilgili çalışma grubu oluşturulduğunu, değişiklik tekliflerinin hazırlanarak Donanma Komutanlığı'na sunulduğunı belirtti.
Karasabun komutanına gönderdiği 10 Ocak 2003 tarihli 'gizli' ibareli belgede ise iptal yetkisinin Deniz Kuvvetleri Komutanı Özden Örnek'e verilmesi gereken angajman kurallarını sıraladı. Karasabun, belgede “Tahrik edici her türlü hareket ve manevra yasaktır”, “Düşmanca niyete maruz kalınması dışında, düşmanca niyet gösterisi yasaktır”, “Düşmanca harekete, kendini koruma dışında cevap vermek yasaktır”, “Enerjik manevralar yapmak, fasılalı olarak üzerine rota değiştirmek yasaktır”, “Güverteye silahlı personel çıkarmak yasaktır” gibi kuralların iptal yetkisinin DKK'ya devredilmesini teklif etti.
Balyoz'un eylem planlarından 'Suga'ya, hukuki zemin hazırlama çalışmaları Gölcük Donanma Komutanlığı'nda ele geçirilen proje subayı Dz. Kur. Binbaşı Murat Ö.'nün hazırladığı Aralık 2002 tarihli bilgi notuna da yansıdı. 4 maddelik belgede Genelkurmay Başkanlığı tarafından hazırlıkları süren 'Barbaros Planlama Direktifi'nin güncelleme çalışmalarının son aşamaya geldiği belirtildi. Darbe'ye zemin hazırlamak için Yunanistan'la Ege'de kriz çıkarılmasını öngören 'Suga' eylem planının, Barbaros Direktifi'ne yansıtılacak unsurlarının, planın tamamlanma tarihinden önce Genelkurmay Başkanlığı'na bildirilmesinin önemli olduğu vurgulandı. Notta, “Bu maksatla; konuya ilişkin Donanma Komutanlığı'ndan irtibat kurulabilecek personel kimliklerinin bildirilmesini, arz ederim” denildi.