Mais en 2003, les autorités israéliennes ont changé cette situation en autorisant les colons à prendre d'assaut Al-Aqsa, sans l'approbation du département des dotations islamiques, qui insiste pour qu'il soit mis fin à ces raids.
Les Palestiniens affirment qu'Israël tente de judaïser la ville de Jérusalem-Est, y compris la mosquée Al-Aqsa, et d'en effacer l'identité arabe et islamique.
Les Palestiniens considèrent Jérusalem-Est comme la capitale de l'État qu'ils espèrent créer, sur la base des résolutions de la légitimité internationale, qui ne reconnaissent pas l'occupation de la ville par Israël en 1967 ni son annexion en 1981.